PubMed
MEKK
MEKK (MAPK kinase kinase или MAP3K) - это серин/треонин-спецефичная протеинкиназа, которая действует на MAP kinase kinase.[1]Enzymes and Coenzymes[Ферменты и Коферменты] Enzymes[Ферменты] Transferases[Трансферазы] Phosphotransferases[Фосфотрансферазы] Phosphotransferases (Alcohol Group Acceptor)[Акцепторы спиртовой группы] Protein Kinases[Протеинкиназы] Protein-Serine-Threonine Kinases[Серин-треонин-спецефичные протеинкиназы]
Протеинкиназами называют ферменты, катализирующие перенос фосфата от АТР к специфическому (серину, треонину, тирозину и т.д.) аминокислотному остатку. Важнейшими представителями являются серин-треониновые протеинкиназы и тирозиновые протеинкиназы. Продукты примерно половины всех открытых до сих пор онкогенов - это протеинкиназы, фосфорилирующие белки-мишени по остаткам тирозина, серина или треонина.[2]
Используя поисковую систему PubMed, опишем, что известно о роли белка MEKK, который принимает участие в процессах внутриклеточной регуляции.
| Список запросов в PubMed | ||||
| Запрос | Запрос как его понял PubMed из Search details | Всего находок | Всего в открытом доступе | Всего обзоров |
| MEKK | MEKK[All Fields] | 238 | 137 | 22 |
| MEKK[title] | MEKK[title] AND "loattrfree full text"[sb] | 33 | 17 | 0 |
| MEKK[Title] AND ("2008/03/04"[PDat] : "2013/03/02"[PDat]) | 3 | 3 | 0 | |
MEKK описание статьи
Рассмотрим описание одной экспериментальной open access статьи "Molecular Cloning of Mitogen-activated Protein/ERK Kinase Kinases(MEKK) 2 and 3" (PMID: 8621389).[3]Основная идеи состоит в том, что ее авторы выделили и экспрессировали комплементарные ДНК(кДНК) для двух новых белков MEKK: MEKK 2 и 3. Они при экспрессируется в клетках схожи с Мекк 1 в том, что они способны регулировать MEK и JNKK.
Экспериментальная методика: [3]
Были выделены MEKK 2 и 3 кДНК. Вырожденные праймеры были использованы в полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием первой цепи кДНК, полученные от полиаденилированных РНК из NIH 3T3. Группа из примерно 300 пар оснований была извлечена из ПЦР смеси и продукты были клонированы в pGEM-T (Promega). ПЦР кДНК продукты были выравнены с 1 MEKK аминокислотной последовательностью. На белки MEKK 2 и 3 была помещена эпитопная метка на NH2 терминальный конец вместе с гемагглютиновой меткой последовательностью (HA) GYPYDVPDYAS при использовании ПЦР. Для вставки NH2-терминальной эпитопной метки в MEKK 2 и 3, sense олигонуклеотиды были синтезированы при использовании метионинового кодона (ATG), 33 аминокиислотных остатков кодирующих участок последовательности GYPYDVPDYAS эпитопной метки, и последовательностей из 20 аминокислотных остатков MEKK 2 или 3, начинающихся со 2 кодона. Моноклональное антитело[4] 12CA5 (Berkeley Antibody Co.) было использовано для распознавания гемагглютининовой эпитопной[5] метки закодированной в экспрессированных MEKK 2 и 3. При этом были использованны плазмиды.
Основные выводы:
1 MEKK, 2, и 3 все способны к регуляции и p42/44MAPK и JNK деятельности. MEKK 1 и 2 по всей видимости, преимущественно регулируют пути JNK, в то время как MEKK 3 предположительно служит для активации p42/44MAPK пути в естественных условиях. На основании биохимических характеристик белков MEKK, очевидно, что их деятельность существенно отличается от деятельности Raf-1 и B-Raf киназ. Raf киназы выборочно регулируют MEK 1 и 2 и не распознают JNKK белков. Таким образом, Raf белки, которые развились в многоклеточных организмах, по всей видимости, весьма специфично регулируют p42/44MAPK пути. Способность MEKKs к регулированию нескольких последовательных каскадов протеинкиназ в клетке показывает, что существует другой механизм их регулирования по сравнению с Raf киназами. Простейшее объяснение этого явления может заключаться в том, что MEKK белки, выборочно организованные в "signalsome" комплексы. Наконец, MEKK / JNK пути могут быть активированы разнообразным набором стимулов. Кроме того, не исключено, что MEKK 1, 2 и 3 не только способны регулировать пути JNK, но и другие последовательные каскады протеинкиназ.
Полезные ссылки:
© Nuzhdina Ekaterina, 2012