Overlap area in Angstrom^2 between polygons defined by atoms on successive
bases. Polygons projected in the mean plane of the designed base-pair step.

Values in parentheses measure the overlap of base ring atoms only. Those
outside parentheses include exocyclic atoms on the ring. Intra- and
inter-strand overlap is designated according to the following diagram:

                    i2  3'      5' j2
                       /|\      |
                        |       |
               Strand I |       | II
                        |       |
                        |       |
                        |      \|/
                    i1  5'      3' j1

     step      i1-i2        i1-j2        j1-i2        j1-j2        sum
   1 GG/UC  0.90( 0.00)  0.00( 0.00)  0.02( 0.00)  1.32( 0.00)  2.24( 0.00)
   2 GC/GU  6.86( 4.14)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.65( 4.06) 13.51( 8.20)
   3 CC/GG  0.74( 0.16)  0.00( 0.00)  0.19( 0.00)  2.64( 1.17)  3.57( 1.33)
   4 CC/GG  0.40( 0.00)  0.00( 0.00)  0.07( 0.00)  4.01( 2.73)  4.48( 2.73)
   5 CC/GG  0.65( 0.17)  0.00( 0.00)  0.17( 0.00)  2.62( 1.17)  3.44( 1.34)
   6 CA/UG  0.59( 0.00)  0.00( 0.00)  1.37( 0.63)  0.00( 0.00)  1.96( 0.63)
   7 AG/CU  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.14( 0.00)  1.67( 0.48)  1.81( 0.48)
   8 GG/CC  2.59( 1.07)  0.00( 0.00)  0.75( 0.00)  0.00( 0.00)  3.34( 1.07)
   9 GG/CC  3.42( 1.95)  0.00( 0.00)  0.45( 0.00)  0.60( 0.00)  4.47( 1.95)
  10 GG/CC  5.04( 3.70)  0.00( 0.00)  0.01( 0.00)  0.42( 0.00)  5.46( 3.70)
  11 GG/CC  4.11( 2.49)  0.00( 0.00)  0.20( 0.00)  0.00( 0.00)  4.31( 2.49)
  12 GU/AC  7.24( 4.67)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.97( 1.25) 11.21( 5.92)
  13 UU/GA  7.23( 4.29)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.20( 2.93) 12.43( 7.22)
  14 UA/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)
  15 AG/CC  4.07( 2.23)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.64( 2.61)  9.71( 4.84)
  16 GG/CC  2.76( 1.22)  0.00( 0.00)  0.34( 0.00)  0.60( 0.01)  3.70( 1.22)
  17 GC/GC  5.91( 2.77)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.69( 2.76) 11.59( 5.53)
  18 CC/GG  0.11( 0.00)  0.00( 0.00)  0.81( 0.00)  3.36( 1.93)  4.28( 1.93)
  19 CG/CG  0.03( 0.00)  0.00( 0.00)  5.06( 2.27)  0.00( 0.00)  5.09( 2.27)
  20 GA/GC  2.60( 0.44)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.42( 1.97)  7.02( 2.41)
  21 AG/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.81( 0.00)  1.37( 0.85)  2.17( 0.85)
  22 GU/AC  5.14( 2.34)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.26( 1.87)  8.40( 4.21)
  23 UC/GA  0.28( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.76( 2.35)  4.04( 2.35)
  24 CU/GG  1.38( 0.05)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  2.90( 1.40)  4.27( 1.45)
  25 UA/UG  0.00( 0.00)  2.56( 0.19)  6.17( 4.48)  0.00( 0.00)  8.73( 4.67)
  26 AG/CU  4.86( 2.31)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.86( 2.31)
  27 GG/CC  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)