Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) | |
Альфа-спирали | |||
N(116MET) - O(112ILE) | 3.02 | 172.2 | |
N(112ILE) - O(108MET) | 2.99 | 171.5 | |
N(113THR) - O(109LYS) | 2.89 | 165.7 | |
Бета-тяжи | |||
N(239ASP) - O(208MET) | 3.14 | 155.0 | |
N(210LEU) - O(239ASP) | 2.87 | 158.6 | |
N(241ALA) - O(210LEU) | 2.96 | 160.9 |
Таблица 1. Длины и углы в водородных связях
Проанализировав таблицу 1, можно сделать вывод, что средняя длина водородной связи в альфа-спиралях составляет 2,96Å, в бета-тяжах - 2,92Å. Средний угол N-H-O для альфа-спирали составляет 169,8 градусов, для бета-тяжей - 155,4 градусов. Полученные данные согласуются с литературными данными.
[1] Arunan E. et al, Definition of the hydrogen bond (IUPAC Recommendations 2011)