Визуализация молекул в JMol


Имена атомов Длина связи (Å) Угол N-H-O (°)
Альфа-спирали
N(116MET) - O(112ILE) 3.02 172.2
N(112ILE) - O(108MET) 2.99 171.5
N(113THR) - O(109LYS) 2.89 165.7
Бета-тяжи
N(239ASP) - O(208MET) 3.14 155.0
N(210LEU) - O(239ASP) 2.87 158.6
N(241ALA) - O(210LEU) 2.96 160.9

Таблица 1. Длины и углы в водородных связях

Выводы

Проанализировав таблицу 1, можно сделать вывод, что средняя длина водородной связи в альфа-спиралях составляет 2,96Å, в бета-тяжах - 2,92Å. Средний угол N-H-O для альфа-спирали составляет 169,8 градусов, для бета-тяжей - 155,4 градусов. Полученные данные согласуются с литературными данными.

Список литературы

[1] Arunan E. et al, Definition of the hydrogen bond (IUPAC Recommendations 2011)