NCBI

Описание сборки генома эукариотического организма

Лев (Panthera leo) – это крупная хищная кошка, которая является одним из представителей рода пантер и принадлежит семейству Кошачьих. Обитают на территории Африки.

Рис.1 Лев


Число сборок генома 3
название (assembly name) P.leo_Ple1_pat1.1
AC GCA_018350215.1
assembly level Chromosome
общая длина последовательности 2,297,568,983
число контигов 109
число скэффолдов 54
N50, L50 контигов 90,731,473, 10
N50; L50 скэффолдов 77,781,637; 11
Последовательность контига Лэв

CDS вируса



Запрос 30000:40000[Sequence Length] AND Lipothrixviridae[Organism] AND complete genome
AC NC_048037
Количество результатов 9
Латинское название/TaxID Sulfolobus filamentous virus 1 Viruses; Adnaviria; Zilligvirae; Taleaviricota; Tokiviricetes; Ligamenvirales; Lipothrixviridae; Alphalipothrixvirus; Alphalipothrixvirus SFV1./2304198
Тип генома DNA, linear
Хозяин вируса ulfolobus sp.
Ссылка Липотриксвирус

misc_feature - редкая биологическая функция, которая не может быть описана другим ключом.

AC - AC006522

Рис. 2

exon - область генома, которая кодирует часть сплайсированной мРНК, рРНК и тРНК

AC - AC002982

Рис. 3

unsure - небольшая область секвенированных оснований, обычно 10 или менее по длине, которую невозможно было идентифицировать.

AC - AC137591

variation - родственный штамм, содержащий стабильные мутации оддного и того же гена, отличающийся от предствленной постеледовательности в указанном месте.

AC - AC004182

STS - короткая последовательность ДНК,обычно содержащаяся в одном экземпляре, характеризует расположение в геноме и может быть обнаружена с помощью ПЦР.

AC - EF445049