Из выданного мне списка ID я выбрала ST3GAL4. Из-за подробной визуализации даннх я выбрала базу данных "The Human Protein Atlas". Эта база данных содержит информацию о белках человека, их локализации и экспрессии в тканях и органах. На начальной странице поисковой строки я выбила выбранный ID.
Белок(Бета-галактозид альфа2-3 сиаилтрансфераза), кодируемый геном ST3GAL4, является членом семейства гликозилтрансфераз, ферментов, участвующих в гликозилировании белка. Бета-галактозид альфа2-3 сиаилтрансфераза, участвует в терминальном сиалилитировании гликопротеинов и гликолипидов. Катализирует перенос сиаловой кислоты (N-ацетилнейраминовая кислота; Neu5Ac) из донора нуклеотидного сахара CMP-Neu5Ac на акцептор Galbeta-(1->3)-GalNAc- и Galbeta-(1->4)-GlcNAc- Играет важную роль в гемостазе.
Далее был выбран раздел "RNA DATA". Из представленной ниже гистограммы видно, что в основном, РНК нашего гена экспрессируется в надпочниках и в яичниках женской половой системы.
В данном разделе представлен анализ экспресси ST3GAL4 в заисимости от положения в организме. Соответственно, в мозгу, в эндокринных тканях, в женских половых органах в мышцах преобладает экспрессия РНК. В костном мозге и лимфоидных тканях преобладает экспрессия белка.
На гистограмме ниже представлена более подробная информация об экспрессии белка.
Исследование проводилось на мозгах людей, свиней и мышей. Во всех трех случаях видно, что ST3GAL4 распространен в мозгу повсеместно, однако ни для одного участка не специфичен.
Из представленного ниже боксплота видно, что экспрессия мРНК данного гена может приводить к различным формам рака, наиболее распространенный из которых - меланома.
Из представленного ниже графика можно сделать более точные выводы. Наиболее распространен у исследуемых пациентов был рак щитовидной железы(эндокринная система), рак головы и шеи, а так же рак уретрального канала. В этих органах наблюдалась наибольшая экспрессия.
