#Получение рисунка 1
#Общие параметры
background white
cpk off
wireframe off
ribbons off
cartoon off
backbone off
zoom 60
rotate x -65
rotate z 10
rotate y -15
restrict not water

#Отображение белка
select *A.
cartoon
color group
#"color group" - команда для окраски цепи белка цветовым переходом

#Отображение иона марганца
select MN
color darkorchid
cpk

#Отображение сульфат-иона
select SO4
color cpk
cpk

pause

#Получение рисунка 2
#Общие параметры
select all
cpk off
wireframe off
ribbons off
cartoon off
backbone off
restrict so4 or 132-148 or 92-108
backbone 40
zoom 140
rotate y 15
rotate z -10
rotate x 65
rotate x 55
rotate z -12
rotate y 21

#Отображение лиганда и остатков
select so4 or 100 or 140 #этой командой выделили лиганд и взаимодействующие с ним остатки
wireframe 40
spacefill 70
color cpk

#Отображение цепи
select 132-139 or 141-148 or 92-99 or 101-108 #выделили остатки, расположенные рядом со взаимодействующими с лигандом
color grey
color translucent 0.6

#Подписи
select ARG100.CA or LYS140.CA or SO4.S #выделили по одному атому из взаимодействующих структур
label %n
color label black
font label 15
select SO4.S
set labeloffset  8 0 #смещаем подпись сульфат-иона, чтобы её было видно

#Измерения
measure 2732 666 #измерили расстояние между кислородом сульфат-иона и азотом аргинина
measure 2730 955 #измерили расстояние между кислородом сульфат-иона и азотом лизина