На главную страницу первого семестра

Изображение области связывания аденина с MTNN_ECOLI

На картинке изображена область взаимодействия аденина ADE с белком MTNN_ECOLI, расстояние между которыми равно 3.8 Å. Расстояние определялось при помощи программы RasMol.

План генноинженерного эксперимента:

1) Список аминокислотных остатков молекулы цепи А, контактирующих с лигандом Аденином:  Ile152 
(приведено наименование аминокислоты и её номер в цепи).
2) Предложение замены аминокислотного остатка белка, которая может привести к потере 
способности связывания цепи А с лигандом: замена ILE152 на  пролин.
3) Предложение замены аминокислотного остатка белка, контактирующего с лигандом, но тем не 
менее, предположительно, мало влияющей на способность связывания с ним: замена ILE152 на 
глицин.
4) Обоснование предлагаемых замен:
       		 а) замены, предложеной в Б):  поскольку пролин яляется иминокислотой, 
                    его пространственное расположение в остове белка может расположить 
                    его так, что его остовный атом кислорода не будет взаимодействовать
                    с аденином.
		 б) замены, предложенной в В): поскольку водородной связью соединён 
                    кислород изолейцина находящийся в остове, то замена его на аминокислоты,
                    не содержащие длинных радикалов, не сможет повлиять на связываемость  
                    (кислород в остове во всех аминокислотных остатков располагается на 
                    одном и том же месте) с лигандом.


© Татьяна Минеева,2004