Для работы выбрала домен С-конца ацилглицеролкиназы (ID: AGK_C, Accesion: PF19712). Число последовательностей seed - 20, full - 493. Проект в JalView доступен по ссылке.
Паттерн: WG[SAN][LFY]RD[AVT][GSTA][ATVIS][KNST][VFILT][SKP][KN]Y[WL]YLGP[LM]K[KITAD][KQNYSRV]A
Координаты: 6:29.
На гомологичность указывает замена ряда аминокислот на сходные по свойствам (например, гидрофобной на гидрофобную), наличие консервативных для всех 20 последовательнотей аминокислот (например, 5 и 6 позиции).
Паттерн: WP[QLP][VQSITN][HR][QRELDN][ATVIL][SATL][LIV][SLMT][YLFCH][ALQT][AGEM]P[TKRNA][EPLK]R
Координаты: 39:55
Отнесла к частичным плюс-блокам, поскольку, вероятно, в послеовательности A0A401SZF8_CHIPU/218-380 произошла делеция этого участка. На гомологию, как и в предыдущем случае, указывают консервативные позиции и замены на аминокислоты со сходными свойствами
Координаты: 271:274
Конец выравнивания. Слева находится частичный плюс-блок с паттерном R.[QKE][VML]L