#скрипт к рисунку 1
background white
reset
select all 
cpk off
wireframe off
backbone off
ribbons off
isosurface off
label off
cartoons
color chain
color translucent 0.7

select 1-3 and not *a
cartoons off
#убрали модель субстрата UVRB_BACSU (ДНК Bacillus subtilis)

select 662
cartoons off
wireframe 55
color cpk
#выделили кофермент UVRB_BACSU

select all and not (662 or (1-3 and not *a))
isosurface sasurface 0.5 translucent 0.5
#обозначили модель поверхности UVRB_BACSU

zoom 100
rotate x 95
rotate y -10
rotate z -15

pause

#скрипт к рисунку 4
background white
reset
select all 
cpk off
wireframe off
ribbons off
cartoons off
isosurface off
label off
backbone 40
color cpk
color translucent 0.7

select 1-3 and not *a
backbone off
#убрали модель субстрата UVRB_BACSU (ДНК Bacillus subtilis)

select 662
backbone off
wireframe 55
color cpk
#выделили кофермент UVRB_BACSU

select (11 or 12 or 44 or 543) and *a
backbone off
wireframe 40
color cpk
#выделили аминокислотные остатки, с которыми взаимодействует кофермент UVRB_BACSU 

select within (3, 662) and water
cpk 80
color green
#выделили молекулы воды, с которыми взаимодействует кофермент UVRB_BACSU

zoom 110
rotate x -10
rotate y 20

pause

#скрипт к рисунку 5
background white
reset
select all 
cpk off
wireframe off
backbone off
ribbons off
cartoons off
isosurface off
label off

select 662
wireframe 55
color cpk
#выделили кофермент UVRB_BACSU

select (11 or 12 or 44 or 543) and *a
wireframe 40
color cpk
#выделили аминокислотные остатки, с которыми взаимодействует кофермент UVRB_BACSU 

select within (3, 662) and water
cpk 80
color green
#выделили молекулы воды, с которыми взаимодействует кофермент UVRB_BACSU

select 662:a.c3'
label ADP
color label black
set fontsize 20
set labeloffset 20 0

select 11:a.ca
label Tyr11
color label black
set fontsize 20

select 12:a.ca
label Gln12
color label black
set fontsize 20
set labeloffset 20 0

select 44:a.ca
label Gly44
color label black
set fontsize 20

select 543:a.ca
label Arg543
color label black
set fontsize 20
set labeloffset 20 0

select (702:a.o or 728:a.o)
label HOH
color label black
set fontsize 20

zoom 600       
rotate x 3     
rotate y 33