Учебный сайт Олеси Климчук

Геномные браузеры

Информация о гене, полученная из UCSC genome browser
Краткое имя гена PRKCB
Полное имя гена Homo sapiens protein kinase C, beta
Цепь "+"
Хромосома XVI
Плечо и полоса p12.2
Координаты 23847300-24231932
Число транскриптов 2
Транскрипт 1 Координаты 23847497-24231434
Число экзонов 17
Длина продукта 671 аминокислота
Транскрипт 2 Координаты 23847497-24226137
Число экзонов 17
Длина продукта 673 аминокислоты
Рисунок 1. Ген, кодирующий Protein kinase C beta type. На рисунке обозначены:
• Ген по данным USCS и RefSeq
• Сайты метилирования ДНК в гене
• Консервативность гена среди позвоночных
• Полиморфизм гена

С помощью EnsEMBL было построено парное выравнивание генов человека и шимпанзе, кодирующих Protein kinase C beta type: human_chimpanzee.clw В этом выравнивании на 100 нуктеотидов 1.08 отличий (информация получена командой distmat human_chimpanzee.clw).
С помощью EnsEMBL была получена информация о числе полиморфизмов этого гена среди людей: 31007.

Дата последнего изменения: 29.12.13

© Олеся Климчук, 2012