Геномные браузеры
Информация о гене, полученная из UCSC genome browser | ||
Краткое имя гена | PRKCB | |
Полное имя гена | Homo sapiens protein kinase C, beta | |
Цепь | "+" | |
Хромосома | XVI | |
Плечо и полоса | p12.2 | |
Координаты | 23847300-24231932 | |
Число транскриптов | 2 | |
Транскрипт 1 | Координаты | 23847497-24231434 |
Число экзонов | 17 | |
Длина продукта | 671 аминокислота | |
Транскрипт 2 | Координаты | 23847497-24226137 |
Число экзонов | 17 | |
Длина продукта | 673 аминокислоты |
Рисунок 1. Ген, кодирующий Protein kinase C beta type. На рисунке обозначены:
Ген по данным USCS и RefSeq
Сайты метилирования ДНК в гене
Консервативность гена среди позвоночных
Полиморфизм гена
Ген по данным USCS и RefSeq
Сайты метилирования ДНК в гене
Консервативность гена среди позвоночных
Полиморфизм гена
С помощью EnsEMBL было построено парное выравнивание генов человека и шимпанзе, кодирующих Protein kinase C beta type:
human_chimpanzee.clw
В этом выравнивании на 100 нуктеотидов 1.08 отличий (информация получена командой distmat human_chimpanzee.clw
).
С помощью EnsEMBL была получена информация о числе полиморфизмов этого гена среди людей: 31007.