Учебный сайт Олеси Климчук

Нуклеотидные банки данных

С помощью SRS в RefSeq_DNA (release) был получен список хромосом Saccharomyces cerevisiae:

	REFSEQ_DNA:NC_001133	NC_001133	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome I, complete sequence. 	230218	
	REFSEQ_DNA:NC_001134	NC_001134	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome II, complete sequence. 	813184	
	REFSEQ_DNA:NC_001135	NC_001135	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome III, complete sequence. 	316620	
	REFSEQ_DNA:NC_001136	NC_001136	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IV, complete sequence. 	1531933	
	REFSEQ_DNA:NC_001137	NC_001137	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome V, complete sequence. 	576874	
	REFSEQ_DNA:NC_001138	NC_001138	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VI, complete sequence. 	270161	
	REFSEQ_DNA:NC_001139	NC_001139	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VII, complete sequence. 	1090940	
	REFSEQ_DNA:NC_001140	NC_001140	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VIII, complete sequence. 	562643	
	REFSEQ_DNA:NC_001141	NC_001141	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IX, complete sequence. 	439888	
	REFSEQ_DNA:NC_001142	NC_001142	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome X, complete sequence. 	745751	
	REFSEQ_DNA:NC_001143	NC_001143	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XI, complete sequence. 	666816	
	REFSEQ_DNA:NC_001144	NC_001144	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XII, complete sequence. 	1078177	
	REFSEQ_DNA:NC_001145	NC_001145	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIII, complete sequence. 	924431	
	REFSEQ_DNA:NC_001146	NC_001146	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIV, complete sequence. 	784333	
	REFSEQ_DNA:NC_001147	NC_001147	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XV, complete sequence. 	1091291	
	REFSEQ_DNA:NC_001148	NC_001148	Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XVI, complete sequence. 	948066
			

Описание IV хромосомы Saccharomyces cerevisiae:
• длина: 1531933 пар нуклеотидов
• число генов: 788
• число молекул тРНК: 28

Примеры генов IV хромосомы Saccharomyces cerevisiae
Цепь Тип гена Название гена Координаты экзонов
"+" С интроном RPP1B 229906..230019,230321..230527
Без интронов STF1 229171..229431
"-" С интроном HNT1 239019..239398,239510..239606
Без интронов ATG31 488072..488662

Просмотреть файл uvrb_bacsu.entret (получен в программе entret командой entret sw:p37954 -auto)
Скачать файл al009126.entret (получен в программе entret командой entret embl:al009126 -auto)
Просмотреть файл al009126.fasta (получен в программе seqret командой seqret al009126.entret -sask)

Дата последнего изменения: 27.12.13

© Олеся Климчук, 2012