Классификация ферментов
Фактор инициации транскрипции TF2D (субъединица 1):
• UniProt AC: P21675
• EC:
| Class | 2 | Transferases | Трансферазы |
| Subclass | 2.7 | Transferring phosphorus-containing groups | Переносчики фосфор-содержащих групп |
| Subsubclass | 2.7.11 | Protein-serine/threonine kinases | Белковые-серин/треониновые киназы |
| Number | 2.7.11.1 | Non-specific serine/threonine protein kinase | Неспецифичная серин/треониновая протеин киназа |
• Схема катализируемой реакции:
Ферменты человека, имеющие функцию, близкую к функции неспецифичной серин/треониновой протеин киназы, найденные в SwissProt с помощью SRS:
| Class | 2 | Query "([swissprot-Description:2.*.*.*] & [swissprot-Organism:human*])" | 1 460 entries |
| Subclass | 2.7 | Query "([swissprot-Description:2.7.*.*] & [swissprot-Organism:human*])" | 916 entries |
| Subsubclass | 2.7.11 | Query "([swissprot-Description:2.7.11.*] & [swissprot-Organism:human*])" | 378 entries |
| Number | 2.7.11.1 | Query "([swissprot-Description:2.7.11.1*] & [swissprot-Organism:human*])" | 295 entries |
Ферменты мыши, имеющие функцию, близкую к функции неспецифичной серин/треониновой протеин киназы, найденные в UniProt:
| Class | 2 | organism:"Mus musculus [10090]" AND ec:"Transferases (2.-.-.-) [2.-.-.-]" | 1 733 entries |
| Subclass | 2.7 | organism:"Mus musculus [10090]" AND ec:"Transferases (2.7.-.-) [2.7.-.-]" | 902 entries |
| Subsubclass | 2.7.11 | organism:"Mus musculus [10090]" AND ec:"Transferases (2.7.11.-) [2.7.11.-]" | 414 entries |
| Number | 2.7.11.1 | organism:"Mus musculus [10090]" AND ec:"Transferases (2.7.11.1) [2.7.11.1]" | 267 entries |
Файл с fasta-последовательностями всех найденных в UniProt трансфераз мыши:
mouse_transferases.fasta
Файл с ID и EC всех найденных в UniProt трансфераз мыши:
mouse_transferases.txt
Файл с результатом поиска трансфераз мыши, сходных по последовательности с неспецифичной серин/треониновой протеин киназой человека: mouse_transferases.blast
Среди всех трансфераз мыши было найдено семь предполагаемых гомологов неспецифичной серин/треониновой протеин киназы человека. Однако достоверными гомологами, по-видимому, можно считать лишь две находки, относящиеся к подклассу переносчиков фосфор-содержащих групп:
| ID находки | e-value находки | EC находки | Сходство |
| TAF1_MOUSE | 0.0 | 2.7.11.1 | Номер |
| KAT2A_MOUSE | 2e-14 | 2.3.1.48 | Класс |
| KAT2B_MOUSE | 1e-12 | 2.3.1.48 | Класс |
| BAZ1B_MOUSE | 1e-09 | 2.7.10.2 | Подкласс |
| CBP_MOUSE | 2e-09 | 2.3.1.48 | Класс |
| EP300_MOUSE | 1e-08 | 2.3.1.48 | Класс |
| ASH1L_MOUSE | 5e-04 | 2.1.1.43 | Класс |