Практикум 6
Описание белка выживаемости 5'-нуклеотидазы из генома бактерии Xylella fastidiosa 9а5с
Основная информация о белке.
Данные о белке, найденные на сайтах NCBI и UniProt, приведены в таблице 1.
| Идентификатор белка | AAF83668.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | AE003849.1 |
| Название белка | 5'-нуклеотидаза |
| Координаты гена в геноме | 819161..819949 |
| Длина гена (п.н.) | 789 |
| Цепь | обратная |
| Длина белка (а.о.) | 262 |
Последовательность белка была получена с сайта NCBI. Вы можете скачать аминокислотную последовательность белка в формате fasta.
Данный белок - нуклеотидаза, которая показывает активность фосфатазы на 5'-монофосфатах нуклеозидов. Xylella fastidiosa - это грамотрицательная растительно-патогенная бактерия, которая приспособлена для проживания внутри сосудов ксилемы хозяев растений. Считается, что биопленка, образованная внутри сосудов ксилемы, играет ключевую роль в развитии болезней, препятствуя прохождению воды от корня до воздушных частей растения. Бактерия заражает несколько экономически важных сельскохозяйственных культур, включая виноград, цитрусовые, миндаль и персик, а также множество ландшафтных деревьев и растений.
Геномное окружение гена белка
Геномное окружение гена, кодирующего данный белок, взятое c сайта NCBI представлено на рисунке 1.
Выполнив практикум, более или менее поняла как находить данные о белках и геномах и усовершенстовала навыки работы с html.