(((((STRPN, STRP1), LACLM), LACDA), (STAAR, STAES)), MOOTA);
На основе этой формулы с помощью программы MEGA я построила изображение дерева:
Рис.1 Изображение дерева
Нетривиальные деревья
Мы называем ветвь нетривиальной, если она разбивает множество листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента. Получилось следующее:
{STRPN, STRP1} vs {LACLM, LACDA, STAAR, STAES, MOOTA}
{STRPN, STRP1, LACLM} vs {LACDA, STAAR, STAES, MOOTA}
{STRPN, STRP1, LACLM, LACDA} vs { STAAR, STAES, MOOTA}
{STRPN, STRP1, LACLM, LACDA, MOOTA} vs {STAAR, STAES}
Практикум 2.
Реконструкция филогении.
Задание 1
С помощью таксономического сервиса NCBI я определила,
к каким таксонам относятся отобранные 7 бактерий (см. Таблица 2).
Похоже, что нетривиальными ветвями моего дерева оказались следующие таксоны (см. рис.2): Bacilli, Lactobacillales, Bacillales, Streptococcaceae и Streptococcus.
