Торсионные (двугранные углы)

 На Главную
Первый Семестр
     

1. Торсионные (двугранные углы) LUXS_BACSU (PDB ID 1IEO).

Таблица. Измерение торсионных углов остатка Asp10 в белке LUXS_BACSU, цепь А.

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках – название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. LEU9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. ASP10:A.N (амидный азот 10-го остатка цепи А)
  3. ASP10:A.CA (α-углерод 10-го остатка цепи А)
  4. ASP10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
N10 - C&alpha10 -85,40°
ψ
  1. ASP10:A.N (амидный азот 10-го остатка цепи А)
  2. ASP10:A.CA (α-углерод 10-го остатка цепи А)
  3. ASP10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  4. HIS11:A.N (амидный азот 11-го остатка цепи А)
C&alpha10 - C10 95,80°
ω
  1. ASP10:A.CA (α-углерод 10-го остатка цепи А)
  2. ASP10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  3. HIS11:A.N (амидный азот 11-го остатка цепи А)
  4. HIS11:A.CA (α-углерод 11-го остатка цепи А)
C10 - N11 -177,61°

2. Угол φ.


Серый - углерод,
Синий - азот.
Скрипт можно увидеть здесь

3. Kарты Рамачандрана.


Для большинства аминокислотных остатков характерны отрицательные значения φ.
Для аминокислотных остатков в α-спиралях характерные значения φ лежат в диапазоне от -90° до -50°,а для ψ - от -60° до 0°.
Для аминокислотных остатков в β-слоях характерные значения φ лежат в диапазоне от -150° до -60°,а для ψ - от 90° до 160°.