Описание глюкозо-фруктозооксидоредуктазы из генома альфа-протеобактерии Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 = ATCC 31821.
Основная информация о белке.
Данные о характеристиках белка были получены из баз даннных NCBI и Uniprot. Полученные данные приведены в таблице 1.
| Идентификатор белка | AAV89313.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | AE008692.2 |
| Название белка | Глюкозо-фруктозооксидоредуктаза (Glucose-fructose oxidoreductase) |
| Координаты гена в геноме | 683742..685043 |
| Длина гена (п.н.) | 1302 |
| Цепь | Обратная |
| Длина белка (а.о.) | 433 |
Последовательность белка получена из базы данных NCBI созданием файла FastA-формата.
Изученный белок является катализатором реакции окисления D-глюкозы и D-фруктозы до D-глюколактона и D-глюцита (D-сорбитола) соответственно.
Геномное окружение белка.
Данные о геномном окружении белка получены из базы данных NCBI по геномному идентификатору бактерии, синтезирующей данный белок. Фрагмент, содержащий информацию о белке, представлен на рисунке 1.
Рисунок 1. Геномное окружение гена белка глюкозо-фруктозооксидоредуктазы (идентификатор белка AAV89313.1). Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI.
С помощью геномного браузера можно упростить анализ нуклеотидных последовательностей путём визуализации положений важных участков генома относительно друг друга. На изображении видно, что рамки считывания не соответсвуют расположениям информации о синтезируемых белках, так как определяются лишь стоп-кодоном.