Нуклеотидные банки данных

Выбранным организмом является Травяная лягушка (лат. Rana temporaria, англ. Common frog). Широко распространена в европейской части России, в том числе обитает в Московской области. Меня заинтересовала из-за работы именно с этим видом лягушек на практикуме по зоологии позвоночных на 1 курсе, а так же из-за того, что мы наблюдали несколько особей вживую на Звенигородской биологической станции. Хромосомный набор представлен 26 хромосомами (10 больших и 2 малых V-образных, 12 J- или палочковидных и 2 зерноподобных)

Поисковой запрос: Rana temporaria (common frog)

В выдаче было 3 сборки.

Я выбрала сборку GCA_905171775.1 , она является референсной(то есть это отобранная вручную высококачественная сборка генома, которую NCBI и сообщество определили как важную в качестве стандарта, с которым сравниваются другие данные) и собрана на уровне хромосом.

Задание 2

N50: Длина контига(скэффолда), для которого половина (50%) всех нуклеотидов сборки содержится в контигах(скэффолдах) такой и большей длины

L50: Число контигов(скэффолдов) (наименьшее), в которых содержится половина (50%) всех нуклеотидов сборки

Задание 3

Все необходимые файлы я скачала через сайт NCBI