Все задания выполнены с помощью файлов из папки /P/y21/term3/pr9
Результаты представлены в файле ~/term3/pr9/emboss.txt
seqret "/P/y21/term3/pr9/to_join/*" fasta::num1.fasta
seqretsplit "/P/y21/term3/pr9/to_split/*"
transeq "/P/y21/term3/pr9/coding.fasta" -frame 1 -table 0 "fasta::num4.fasta"
getorf "/P/y21/term3/pr9/coding.fasta" -minsize 300 -table 1 "num5.orf"
seqret "/P/y21/term3/pr9/alignment.fasta" "msf::num6.msf"
Скрипт находится в файле ~/term3/pr9/edirect.sh , файлы выдачи NZ_CP019604.1.json и NZ_CP019604.1_proteins.fasta лежат в папке ~/term3/pr9, результат работы третьего конвейера: 9298091 6264810