Филогенетическое дерево

Для построения дерева были выбраны следующие бактерии:

Название	Мнемоника
Bacillus subtilis	BACSU
Clostridium botulinum	CLOBA
Clostridium tetani	CLOTE
Enterococcus faecalis	ENTFA
Lactobacillus acidophilus	LACAC
Listeria monocytogenes serovar 1/2a	LISMO
Staphylococcus epidermidis	STAES
Streptococcus pneumoniae	STRPN

Скобочная формула дерева:
((((ENTFA,STRPN),LACAC),((BACSU,LISMO),STAES)),(CLOTE,CLOBA));

Изображение дерева:

Дерево содержит 5 нетривиальных ветвей:

1) {CLOTE,CLOBA} против {LACAC,ENTFA,STRPN,BACSU,LISMO,STAES}
2) {ENTFA,STRPN} против {CLOTE,CLOBA,LACAC,BACSU,LISMO,STAES}
3) {LACAC,ENTFA,STRPN} против {CLOTE,CLOBA,BACSU,LISMO,STAES}
4) {BACSU,LISMO} против {CLOTE,CLOBA,LACAC,ENTDA,STRPN,STAES}
5) {BACSU,LISMO,STAES} против {CLOTE,CLOBA,LACAC,ENTDA,STRPN}

Таксономия

Таксономия выбранных бактерий

ID	Класс	Порядок	Семейство	Род	Вид
CLOBA	Clostridia	Clostridiales	Clostridiaceae	Clostridium	Clostridium botulinum
CLOTE	Clostridia	Clostridiales	Clostridiaceae	Clostridium	Clostridium tetani
BACSU	Bacilli	Bacillales	Bacillaceae	Bacillus	Bacillus subtilis
ENTFA	Bacilli	Lactobacillales	Enterococcaceae	Enterococcus	Enterococcus faecalis
LACAC	Bacilli	Lactobacillales	Lactobacillaceae	Lactobacillus	Lactobacillus acidophilus
LISMO	Bacilli	Bacillales	Listeriaceae	Listeria	Listeria monocytogenes serovar 1/2a
STAES	Bacilli	Bacillales	Staphylococcaceae	Staphylococcus	Staphylococcus epidermidis
STRPN	Bacilli	Lactobacillales	Streptococcaceae	Streptococcus	Streptococcus pneumoniae

Ветвь 1 отделяет род Clostridium, в него входят CLOB1 и CLOTE
Ветвь 2 отделяет класс Bacilli, в него входят ENTFA, LACAC, STRPN, BACSU, LISMO, STAES
Ветвь 3 отделяет порядок Lactobacillales, в него входят ENTFA, STRPN, LACAC.
Ветвь 4 отделяет порядок Bacillales, в него входят BACSU, LISMO, STAES

Источники:

[1] NCBI