Xylanimonas cellulosilytica

Таксономия

Таксон Название
Царство Bacteria
Тип Actinobacteria
Класс Actinomycetales
Отряд Micrococcineae
Семейство Promicromonosporaceae
Род Xylanimonas
Вид Xylanimonas cellulosilytica

Описание вида

Образует штаммы бактерий в форме кокков и укороченных палочек (их типичный размер: примерно 1,1 х 0,8 мкм).

Единственными источниками углерода являются крахмал и ксилан. При попытках исследователей выращивать штаммы с ацетатами, цитратами, глюконатами, инозитами и др. рост не наблюдался.

Сахара клеточной стенки - рамноза, галактоза.

Основные липиды (полярные) - фосфатидилглицерин, фосфатидилинозитол и др.

Геном включает в себя главную кольцевую молекулу ДНК и одну плазмиду.

Геном бактерии секвенировали на основе филогенетического положения вида, он входит в проект «Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea».

Кроме того, эта бактерия привлекает своей способностью к гидролизу целлюлозы и ксилана, которая ей свойственна благодаря синтезу различных гидролитических ферментов (целлюлаза, ксиланаза). Также синтезируют амилазы, желатиназы, галактозидазы и каталазы.

На основании выше изложенных особенностей можно заключить, что бактерии можно использовать в промышленности. Cellulolytic enzymes – целлюлазы – могут быть использованы в пищевой, бумажной, текстильной промышленности, в производстве биотоплива.

[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3035249/ ]

Статья PubMed

Complete genome sequence of Xylanimonas cellulosilytica type strain (XIL07)

Авторы: Foster B, Pukall R, Abt B, Nolan M, Glavina Del Rio T, Chen F, Lucas S, Tice H, Pitluck S, Cheng JF, Chertkov O, Brettin T, Han C, Detter JC, Bruce D, Goodwin L, Ivanova N, Mavromatis K, Pati A, Mikhailova N, Chen A, Palaniappan K, Land M, Hauser L, Chang YJ, Jeffries CD, Chain P, Rohde M, Goker M, Bristow J, Eisen JA, Markowitz V, Hugenholtz P, Kyrpides NC, Klenk HP, Lapidus A.

Текс аннотации статьи:

Xylanimonas cellulosilytica Rivas et al. 2003 is the type species of the genus Xylanimonas of the actinobacterial family Promicromonosporaceae. The species X. cellulosilytica is of interest because of its ability to hydrolyze cellulose and xylan. Here we describe the features of this organism, together with the complete genome sequence, and annotation. This is the first complete genome sequence of a member of the large family Promicromonosporaceae, and the 3,831,380 bp long genome (one chromosome plus an 88,604 bp long plasmid) with its 3485 protein-coding and 61 RNA genes is part of the Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea project. [ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21304672 ]

Перевод аннтоации статьи на русский язык:

«Xylanimonas cellulosilytica (Ривас и сооавторы, 2003) - вид рода Xylanimonas из семейства Promicromonosporaceae. X. cellulosilytica представляет интерес из-за его способности к гидролизу целлюлозы и ксилана. Здесь мы опишем особенности данного организма, а также представим полную последовательность его генома. В статье впервые приведена последовательность генома одного из представителей семейства Promicromonosporaceae. Геном включает 3831380 пар нуклеотидов (п. н.): одна хромосома - 3742776 п. н., плазмиды - 88604 п. н.), 3485 кодирующих белок генов, 61 РНК-генов. Геном входит в проект Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea.»

Запрос в PubMed, с помощью которого найдена указанная статья: "Xylanimonas cellulosilytica" (название бактерии).

PMID (PubMed ID, идентификатор PubMed): 21304672

Микрофотография культуры бактерии
Photo of Xylanimonas

Scanning electron micrograph of X. cellulosilytica XIL07

(Сканирующая электронная микроскопия X. cellulosilytica XIL07)

[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3035249/figure/f2/]

Статистика генома

Длина генома 3742776 пар оснований
Длина CDS (кодирующей последовательности ДНК) 1020269 пар оснований
Содержание пар GC (нуклеотиды G,C) 72,5%
Общее число генов 3337

[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21304672]

Последнее изменение: 21-10-2012 (pankevich-ev)