Данные структурных факторов
Изучение полноты данных в файле структурных факторов 1bl8
В данной работе представлена информация о файле структурных факторов для модели 1bl8.
Файл структурных факторов находится в PDB, его также можно скачать в формате excel по ссылке; на листе "Таблица" находится матрица с данными для структурных файторов (на листе "1bl8" находится исходный файл из PDB). Файл создан в 1998 году и откорректирован в соответствии со стандартами в 2013 году. Файл содержит 12177 структурных факторов,
- 10913 ("о" в колонке "_refln.status") использовались для построения и оптимизации модели;
- 1265 ("f" в колонке "_refln.status") использовались для R-free.
Был произведен поиск неизмеренных структурных факторов. Эти факторы соответствуют явно пропущенным тройкам чисел (h,k, l). Явно пропущенные - это такие, что (1) их нет в файле; (2) хотя бы одна тройка (h',k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l присутствует в файле. Ниже представлены примеры неизмеренных структурных факторов.
Имеется большое количество факторов, соответствующих тройкам целых h,k,l.
Примеры пропущенных структурных факторов:
- (18,9,i), где i=[1,n], т.е. любое ни один из рефлексов, где h=18 и k=9 не измерены, хотя есть измеренные рефлексы все числа из тройки больше, например, (19,11,8)
- и др.
Строки о всех неизмеренных рефлексах не присутствуют в исходном файле. Поэтому в колонке "_refln.status" нет статуса "х", что можно наблюдать во многих других файлах.
Вас приветствует целая культура хозяев белка, Streptomyces lividans.