ФББ 2013-2014

Дисульфидные мостики в белке с pdb-идентификатором 3GBY (белок с неизвестной функцией CT1051).

В белке дисульфидного обмена S-S связей не оказалось, поэтому я нашла в базе данных pdb ещё один белок, принадлежащий Chlorobium tepisum TLS.

Дисульфидные мостики - это связи между двумя атомами серы разных остатков серосодержащих аминокислот. Это ковалентное взаимодействие, оно намного прочнее рассмотренных ранее водородных связей и электростатических взаимодействий. Они придают структуре белка жёсткость и разорвать эти связи непросто.

Рис. 1. Структура белка с pdb-идентификатором 3GBY. Серосодержащие группы выделены жёлтыми шариками. Всё остальное показано в проволочной модели (wireframe) и color translucent.

На рисунке 1 изображены все серосодержащие группы исследуемого белка. Среди них: остатки цистеина (CYS), лиганд - анион SO4, EPE .

Как мы видим, только близкорасположенные остатки CYS образуют дисульфидный мостик. Рассмотрим S-S связь более детально. На рисунке 2 изображена один из дисульфидных мостиков. Остатки цистеина, участвующие в его образовании, подписаны. Сам мостик обозначен оранжевой линией.

Рис. 2. Дисульфидный мостик между 35 [CYS] и 96 [CYS].