ФББ 2013-2014

Работа в ChemSketch

ChemSketch - программа, которая позволяет воссоздавать структуры биологических молекул. Для создания нуклеиновых кислот и других биологических молекул удобно использовать шаблоны. Также программа позволяет нумеровать атомы, выделять связи и атомы разными цветами и др. С помощью её инструментов возможно достаточно наглядно представить органическую молекулу.

В задании 1 необходимо было изобразить 4 молекулы: 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин и псевдроуридин. Результаты представлены на рисунках 1 и 2, красным цветом обозначена N-гликозидная связь.

Рис.1. 2'-дезоксигуанозиндифосфат и 2'-дезокситимидинмонофосфат.

Рис.2. Уридин и псевдоуридин.

В задании 2 нужно было изобразить структуру двойной цепи ДНК, указать водородные связи между основаниями. Результаты представлены на рисунке 3.

Рис.2. Двойная цепь ДНК. Названия нуклеотидов подписаны внутри. Водородные связи показаны пунктирной линией. Полярность цепи обозначена малиновой стрелкой.

Результаты работы в формате .sk2 можно скачать здесь и здесь.