Описание белка AJG99379.1 и его геномного окружения

Описание белка сиалидазы* и его геномного окружения



Таблица 1. Описание сиалидазы из генома бактерии Clostridium beijerinckii
Параметр Значение
Идентификатор белка AJG99379.1
Идентификатор генома CP010086
Координаты гена в геноме 3087698..3089965
Длина гена (в парах нуклеотидов) 2268
Цепь (прямая или обратная) Прямая
Длина белка (в аминокислотных остатках) 755



Аминокислотная последовательность сиалидазы
>AJG99379.1 sialidase
MIRRNKRILSLTLSMAVFTTMFMSTSFITKAETVSLGANSEITSNASTESTAVATNIA
LNKPSTASSVTGGNTASLAVDGNAGTRWESAQGSDPQWISIDLGGSYNISGVKLNWET
AAAKDYKIQVSTDNKNWIDAYTKTGGTGGVENIAFNSTATGRYIRMLGTTRTTQYGYS
LWEFEVYGIPDGNTVNNVDLGPNVKIFDPSMPSSDIQNTVDSVFSKMETNQFGNERYA
FLFKPGSYNVNVNVGFFTSVLGLGKTPDAVNITGAVRCEADWMGGNATCNFWRSVENV
AVTPTYSSNNLAPAGTLTWAVSQAAPMRRVHIKGGLSLWDPLGTNYDGAWSSGGFIAD
SKIDNSITSGSQQQFFTRNSQMGSWNGANWNMVFVGNNGAPTDDNAYPSTPDTVVSQT
PAIREKPFLYIDDSGNYQVFIPDLRKNSQGITWTNGLGQGTSLSIDQFYIAKPDTSTA
ESINAALSQGKNIIFTPGVYHLSDAINVTKSNTVILGLGLATLIPDNGTAAMNISDVD
GVKVSGVLFDAGAKNSPVLLKVGQDGSSADHSANPTSLSDLFFRIGGAAVGNADTSLK
INSNNVIGDDFWVWRADHGTGVGWTVNNAKNGVIVNGNNVTLYGLFVEHFKEYQTIWN
GNGGKVYFYQSELPYDVPNQASWMSNNGTQNGYASYKVADSVTSHQLFGSGIYSYFRD
SVVSENNGIEVPNASGVKVHHACSVYLSGNGEITHVVNNTGNTAKSGDMKQSVTDYPN
S 


Геномное окружение сиалидазы (AJG99379.1)


Источники:

[1] Shang, H., Zhong, J., Zhang, R. et al. Arch Virol (2015) 160: 1827. doi:10.1007/s00705-015-2426-y
[2]https://www.ncbi.nlm.nih.gov
[3]http://www.bionity.com/en/encyclopedia/Sialidase.html
[2]http://www.multitran.ru


*нейраминидазы

http://www.kodomo.fbb.msu.ru/wiki/

Официальный сайт ФББ МГУ


© Кравченко Павел
2016