На главную страницу
На главную страницу первого семестра

Shikimate Dehydrogenase AROE complexed with NADP+
Шикиматдегидрогеназа AROE

  1. Краткое название белка: AROE_ECOLI
  2. Полное название организма: Escherichia coli, K-12
  3. Название гена: aroE.
  4. Номер локуса в бактериальной хромосоме: b3281
  5. Последовательность в формате FASTA:
    >aroE description
    METYAVFGNPIAHSKSPFIHQQFAQQLNIEHPYGRVLAPINDFINTLNA
    FFSAGGKGANVTVPFKEEAFARADELTERAALAGAVNTLMRLEDGRL
    LGDNTDGVGLLSDLERLSFIRPGLRILLIGAGGASRGVLLPLLSLDCAV
    TITNRTVSRAEELAKLFAHTGSIQALSMDELEGHEFDLIINATSSGISGD
    IPAIPSSLIHPGIYCYDMFYQKGKTPFLAWCEQRGSKRNADGLGMLVA
    QAAHAFLLWHGVLPDVEPVIKQLQEELSA

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав
A (Аланин) 11,029
C (Цистеин) 1,103
D (Аспарагиновая кислота) 4,779
E (Глутаминовая кислота) 6,25
F (Фенилаланин) 5,147
G (Глицин) 9,191
H (Гистидин) 2,941
I (Изолейцин) 6,618
K (Лизин) 2,941
L (Лейцин) 12,868
M (Метионин) 1,838
N (Аспарагин) 4,044
P (Пролин) 4,779
Q (Глутамин) 3,676
R (Аргинин) 4,779
S (Серин) 6,25
T (Треонин) 4,412
V (Валин) 4,779
W (Триптофан) 0,735
Y (Тирозин) 1,838
  • Длина последовательности: 272 а.о.
  • Молярная масса: 29417,5 г/моль.
  • Средний заряд молекулы:
    • +45,6e при рН=1,0,
    • –8,0e при рН=7,0,
    • –9,9e при pH=8,0.
  • Отношение содержания гидрофобных остатков (аланин, цистеин, лейцин, изолейцин, метионин, фенилаланин, валин) к содержанию гидрофильных (аргинин, аспарагин и аспарагиновая кислота, глутамин и глутаминовая кислота, гистидин, лизин, серин): 1,2165, что позволяет думать, что данный белок не является мембранным.


©Семенюк Павел