На главную страницу
На главную страницу второго семестра

Мотивы в белке AROE_ECOLI, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 9
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST]-x(2)-[DE] неспецифична 3
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования протеинкиназы C паттерн [ST]-x-[RK] неспецифична 3
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION Сайт N-гликозилирования паттерн N-{P}-[ST]-{P} неспецифична 3

Проведен поиск мотивов в белке AROE_ECOLI, описанных в БД Prosite. Не найдено ни одного специфичного мотива, все онайденные мотивы встречаются во многих других белках. Это распрастраненные участки, по которым нельзя ничего сказать о белке.
Это может говорить о том, что белок AROE_ECOLI не имеет консервативного короткого фрагмента (или просто он не описан, белки этого класса малоизучены и т.д.).


©Семенюк Павел