Назад на первый семестр

Экзонуклеаза 5 субъеденица

  • Краткое название белка: EX5B_ECOLI
  • Полное название организма: Escherichia coli K-12
  • Название гена: RecB
  • Номер локуса: b2820
  • Аминокислотна последовательность белка EX5B_ECOLI:
    >EX5B_ECOLI exonuclease V subunit
    MSDVAETLDPLRLPLQGERLIEASAGTGKTFTIAALYLRLLLGL
    GGSAAFPRPLTVEELLVVTFTEAATAELRGRIRSNIHELRIACLRETTDNPLYERLLE
    EIDDKAQAAQWLLLAERQMDEAAVFTIHGFCQRMLNLNAFESGMLFEQQLIEDESLLR
    YQACADFWRRHCYPLPREIAQVVFETWKGPQALLRDINRYLQGEAPVIKAPPPDDETL
    ASRHAQIVARIDTVKQQWRDAVGELDALIESSGIDRRKFNRSNQAKWIDKISAWAEEE
    TNSYQLPESLEKFSQRFLEDRTKAGGETPRHPLFEAIDQLLAEPLSIRDLVITRALAE
    IRETVAREKRRRGELGFDDMLSRLDSALRSESGEVLAAAIRTRFPVAMIDEFQDTDPQ
    QYRIFRRIWHHQPETALLLIGDPKQAIYAFRGADIFTYMKARSEVHAHYTLDTNWRSA
    PGMVNSVNKLFSQTDDAFMFREIPFIPVKSAGKNQALRFVFKGETQPAMKMWLMEGES
    CGVGDYQSTMAQVCAAQIRDWLQAGQRGEALLMNGDDARPVRASDISVLVRSRQEAAQ
    VRDALTLLEIPSVYLSNRDSVFETLEAQEMLWLLQAVMTPERENTLRSALATSMMGLN
    ALDIETLNNDEHAWDVVVEEFDGYRQIWRKRGVMPMLRALMSARNIAENLLATAGGER
    RLTDILHISELLQEAGTQLESEHALVRWLSQHILEPDSNASSQQMRLESDKHLVQIVT
    IHKSKGLEYPLVWLPFITNFRVQEQAFYHDRHSFEAVLDLNAAPESVDLAEAERLAED
    LRLLYVALTRSVWHCSLGVAPLVRRRGDKKGDTDVHQSALGRLLQKGEPQDAAGLRTC
    IEALCDDDIAWQTAQTGDNQPWQVNDVSTAELNAKTLQRLPGDNWRVTSYSGLQQRGH
    GIAQDLMPRLDVDAAGVASVVEEPTLTPHQFPRGASPGTFLHSLFEDLDFTQPVDPNW
    VREKLELGGFESQWEPVLTEWITAVLQAPLNETGVSLSQLSARNKQVEMEFYLPISEP
    LIASQLDTLIRQFDPLSAGCPPLEFMQVRGMLKGFIDLVFRHEGRYYLLDYKSNWLGE
    DSSAYTQQAMAAAMQAHRYDLQYQLYTLALHRYLRHRIADYDYEHHFGGVIYLFLRGV
    DKEHPQQGIYTTRPNAGLIALMDEMFAGMTLEEA
Мои вычисления с помощью Excel
A (аланин)0,099152542
C (цистеин)0,008474576
D (аспарагиновая к-та)0,062711864
E (глутаминовая к-та)0,081355932
F (фенилаланин)0,037288136
G (глицин)0,054237288
H (гистидин)0,024576271
I (изолейцин)0,045762712
K (лизин)0,026271186
L (лейцин)0,122033898
M (метионин)0,026271186
N (аспарагин)0,027118644
P (пролин)0,044067797
Q (глутамин)0,060169492
R (аргинин)0,077966102
S (серин)0,054237288
T (треонин)0,050847458
V (валин)0,052542373
W (триптофан)0,019491525
Y (тирозин)0,025423729
  • Длина последовательности: 1180 а.о.
  • По результатам вычислений, молекулярная масса RECB составляет 133.967 kDa.

Средний электрический заряд REcB при трех значениях pH
  • при pH = 1 заряд белка составляет +151.86
  • при pH = 7 заряд белка составляет -43.29
  • при pH = 8 заряд белка составляет -50.20

Отношение гидрофобных аминокислот к гидрофильным в Ex5B_ECOLI равно примерно 1, следовательно можно сказать, что этот белок будет растворимым.

© Пенгрин Маргарита