На главную

Работа с программой BLAST


1.- Мной был проведён поиск последовательности моего белка P08394 программой BLASTP в банке swissprot. Получен результат: порядковый номер 119668, Score 2266, E Value 0.0
- Был повторён поиск, но уже в банке pdb. Первым в списке находок как ни странно оказался мой белок белок: Pdb 1w36; Score 2266; E Value 0.0; Query 1141,1180; Subject 1-1180; Identities 1180/1180 (100%)
2. Был произведен поиск в банке swissprot поис белка P57529. Первой в списке находок был искомый белок: порядковый номер 119668, Score 715,E Value 0.0, Identities 35%, 1-1174 и 1-1174
3. Был проведён поиск в банке swissprot последовательность из файла thirdprot.fasta. Результатом поиска оказался мой белок, чего и следовало ожидать, так как эта искуственно созданная последовательность состоит из склеянных участков моего белка: порядковый номер 119668, Score 29.3,E Value 2.5, 2-22, 614-634.


© Пенгрин Маргарита