Практикум 3

Белок 1UFR

Структура в целом

Тип макромолекулы: РНК-связывающий белок.

Количество полимерных цепей: 4 (A, B, C, D), все идентичны по последовательности, длина последовательности составляет 181 аминокислотный остаток.

Биологическая единица: гомодимер.

Биологическая сборка 1

В кристаллической структуре белок состоит из двух димеров.

Асимметричный блок

Отдельные цепи

Так как белок имеет 4 идентичные цепи по последовательности, то все они имеют общую характеристику.

Организм: Thermus thermophilus .

Uniprot_id: Q5SK65.

Название: Bifunctional protein PyrR (Бифункциональный белок PyrR).

Функция: регулирует ослабление транскрипции оперона пиримидинового нуклеотида (pyr) в ответ на поступление экзогенных пиримидинов. Может действовать как репрессор трансляции: связывание PyrR с предполагаемым сайтом распознавания в транскрипте предотвращает инициацию трансляции лидерного пептида, что приводит к образованию терминатора и снижению экспрессии нижележащих генов. Также проявляет активность уридинфосфорибозилтрансферазы.

Мутации в последовательности относительно референса из Uniprot: нет.

Модифицированные аминокислотные остатки: позиция 1, позиция 8, позиция 13 цепи.

Единственный модифицированный аминокислотный остаток - MSE (селенометионин) - является модификацией метионина.

Селенометионин в файле PDB


Малые молекулы

В записи присутствует 2 типа малых молекул:

1. Лиганды - хлорид-ион (CL).

2. Модифицированные аминокислотные остатки - селенометионин (MSE).

Малые молекулы в файле PDB