С помощью расширенного поиска на сайте UniProt был произведен поиск белков для бактерии Clostridium tetani E88 . На запрос по таксономической принадлежности бактерии программой было выдано 2416 результатов белков, из которых был выбран белок P04958 Tetanus toxin . Выбор данного белка был основан на том, что бактерия Clostridium tetani E88 широко известна своей патогенностью из-за наличия данного белка. Также данный белок был выдан на сайте UniProt первым по счету. У данного белка стоит пометка Reviewed, данный белок очень хорошо аннотирован (5/5).
Данный белок является Тетанотоксином. Тетанотоксин подавляет высвобождение нейромедиаторов. Он связывается с периферическими нейронными синапсами, проникает внутрь и с помощью ретроградного транспорта поднимается по аксону в спинной мозг, где может перемещаться между постсинаптическими и пресинаптическими нейронами.
1) Для бактерии Clostridium tetani E88 (выбрана в поиске в строке Taxonomy) был произведен поиск по ключевому слову (Keyword) Zinc для поиска белков данной бактерии, содержащих в своем составе цинк, как и белок P04958. Результат данного поиска - 91 белок. На основании этого можно сделать вывод, что содержание цинка в белке Тетаноспазмина не уникально.
2) Для бактерии Clostridium tetani E88 (выбрана в поиске в строке Taxonomy) был произведен поиск по ключевому слову (Keyword) Toxin для выявления белков патогенности бактерии. Результат данного поиска - 2 белка (тетаноспазмин и тетанолизин).
3) В поисковой строке (Protein Name) по названию белка (Tetanus toxin) был сделан запрос на поиск. Результат данного поиска - 15 белков. Только 7 из них были выделены из бактерии вида Clostridium tetani .