ПРАКТИКУМ 3

Практикум 3

Петрова Анастасия

Факультет биоинженерии и биоинформатики, Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, Ленинские горы д. 1 стр. 73, 119234, Москва, Россия

СТРУКТУРА В ЦЕЛОМ

4ATE - фермент из класса гидролаз. Белок состоит из одной цепи длиной в 256 аминокислот. Как биологическая единица так же представлен мономером.

ОТДЕЛЬНЫЕ ЦЕПИ

4ATE - бета-порфираназа А из бактерии Zobellia galactanivorans (strain DSM 12802 / CCUG 47099 / CIP 106680 / NCIMB 13871 / Dsij).

uniprot_id:D7GXG0

Функции цепи:

каталитическая активность
участие в метаболизме углеводов
гидролазная активность, гидролиз O-гликозильных соединений

Мутаций относительно референса нет, модифицированных аминокислотных остатков тоже

ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА

Как видно на изображении, бета-листов во вторичной структуре белка гораздо больше, чем альфа-сприралей.

4ate_model-2 — Вторичная структура белка 4ATE. Красным цветом показаны бета-листы, синим - альфа-спирали

МАЛЫЕ МОЛЕКУЛЫ

В записи присутствуют такие малые молекулы как:

SULFATE ION (SO4)

Информация из PDB

CALCIUM ION (CA)

Информация из PDB

CHLORIDE ION (CL)

Информация из PDB