ПРАКТИКУМ 10
Петрова Анастасия
При запуске BLAST были использованы следующие параметры:
При построении выравнивания в Jalview негомологичных белков не нашлось, ввиду высокого процента идентичности последовательностей (наименьший - 69%)
Проект в JalviewВ работе был использован вирус HTRV, он же Heartland virus:
Для исследования был выбран гликопротеин N:
Согласно формуле Карлина, e-value и объем банка находятся в линейной зависимотсти друг от друга. В результате применения фильтра по организмам e-value изменился у L7V0S7_9VIRU с 8.1e-61 до 2.1e-59. Разделив первое значение на второе получим, что доля вирусных белков в Swissprot - 3.86%