Описание бактерии на русском языке [1]:

Повсеместное распространение углеводородов в окружающей среде является следствием процессов, происходящих в осадочных скальных образованиях, содержащих большое количество органических веществ. Тепло и давление приводит к образованию широкого спектра углеводородов, включая алканы, алкены и циклические (а так же полициклические) ароматические углеводороды, которые могут проникать в водную среду. Алканы являются наименее активным классом углеводородов.

При отсутствии высокой температуры, высокого давления, металлических катализаторов или ультрафиолетового света, ферментативно катализированные реакции играют доминирующую роль в разложении алканов (и других углеводородов) в окружающей среде.При этом механизмы аэробного разложения углеводородов были и ранее подробно изучены и описаны, в отличие от механизмов анаэробного разложения, по причине того, что ключевой особенностью аэробного разложения является наличие молекулярного кислорода.

Исключительно важная роль кислорода в качестве основного реагента при аэробном разложении углеводородных соединений привела к заблуждению, что многие алканы практически не разрушимы в бескислородных условиях.

Однако исследования,проведенные в течение последних 15 лет, показали, что некоторые микроорганизмы приспособились использовать углеводородные соединения в качестве субстратов и осуществлять биотрансформацию углеводородных соединений в процессе своей жизнедеятельности в анаэробных условиях. Desulfatibacillum alkenivorans (Рис.1) служит в качестве модели для исследования процессов биотрансформации углеводородов в анаэробных условиях.

Микрофотография D.alkenivorans (Рис.1) [2]:

Рис.1 Черно-белая микрофотография бактерии Desulfatibacillum alkenivorans с нанесенным масштабам в 1 мкм.

Таксономия [3]:
Империя: Cellular organisms
Надцарство: Bacteria
Тип: Proteobacteria
Класс: Deltaproteobacteria
Порядок: Desulfobacterales
Семейство: Desulfobacteraceae
Род: Desulfatibacillum
Вид: Desulfatibacillum alkenivorans

Впервые данный вид бактерий был отобран для проведения исследований из пролива Артур Хилл, разделяющего Нью-Джерси и Нью-Йорк, США [1].

Причины и цели секвенирования [1]:
1. Определить какие именно гены и как отвечают за способность организма участвовать в анаэробном разложении углеводородов.
2. Лучше понять роль микроорганизмов в анаэробном круговороте углерода.
3. Получить информацию о возможности использования данной бактерии на загрязненной территории (например: разлив нефти) для очистки.

Основным источником информации являтеся найденая в БД PubMed статья, посвященная бактерии Desulfatibacillum alkenivorans.

Название этой статьи:
The genome sequence of Desulfatibacillum alkenivorans AK-01: a blueprint for anaerobic alkane oxidation.

Авторы статьи:
Callaghan AV, Morris BE, Pereira IA, McInerney MJ, Austin RN, Groves JT, Kukor JJ, Suflita JM, Young LY, Zylstra GJ,Wawrik B.

Место проведения исследования:
Department of Botany and Microbiology, University of Oklahoma, 770 Van Vleet Oval, Norman, OK 73019-4110, USA. acallaghan@ou.edu

Аннотация статьи:

Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 serves as a model organism for anaerobic alkane biodegradation because of its distinctive biochemistry and metabolic versatility. The D. alkenivorans genome provides a blueprint for understanding the genetic systems involved in alkane metabolism including substrate activation, CoA ligation, carbon-skeleton rearrangement and decarboxylation. Genomic analysis suggested a route to regenerate the fumarate needed for alkane activation via methylmalonyl-CoA and predicted the capability for syntrophic alkane metabolism, which was experimentally verified. Pathways involved in the oxidation of alkanes, alcohols, organic acids and n-saturated fatty acids coupled to sulfate reduction and the ability to grow chemolithoautotrophically were predicted. A complement of genes for motility and oxygen detoxification suggests that D. alkenivorans may be physiologically adapted to a wide range of environmental conditions. The D. alkenivorans genome serves as a platform for further study of anaerobic, hydrocarbon-oxidizing microorganisms and their roles in bioremediation, energy recovery and global carbon cycling. © 2011 Society for Applied Microbiology and Blackwell Publishing Ltd.

Идентификатор статьи в БД PubMed [1]: 21651686
Использовавшийся запрос (в виду скудности материала по данной теме): Desulfatibacillum alkenivorans.

Ссылки на источники:
[1] 2011 Society for Applied Microbiology and Blackwell Publishing Ltd.
[2] genome.jgi-psf.org
[3] Uniport.org