Семейства доменов

1.

Доменная организация белка PYRD_Ecoli

  • Картинка со схематическим изображением доменной структуры PYRD_Ecoli
    • По базе данных Pfam

    На картинке изображено расположение домена дигидрооротатдегидрогеназы ,относительно последовательности всего белка.

  • Картинка с доменами, отмеченными на пространственной структуре PYRD_Ecoli

    • (1F76) На картинки изображены 4 одинаковые цепочки белка.Шариками представлены лиганды. Домен выделен зеленым в лентончной модели.

  • Домены в последовательности PYRD_Ecoli

    Идентификатор Pfam
    Название записи
    Полное название домена
    Положение в последовательности PYRD_Ecoli
    PF01180
    DHO_dh
    Dihydroorotate dehydrogenase (Дигидрооротатдегидрогеназа)
    47-336

    • 2.

    Описание N-концевого домена белка PYRD_Ecoli

    Краткая характеристика домена PF01180.

    Дегидрооротатдигидрогеназы (DHOdehase) катализирует четвертый шаг в биосинтезe пиримидина, преобразует дигидрооротат в оротат. Неотъемлемой частью дигидрооротат дигидрогеназы является FAD (flavine adenine dinucleotide/флавинадениндинуклеотид),таким образом дигидрооротат дегидрогеназа являестся представителем флавопротеинов. В бактериях (ген pyrD), DHOdease расположен на внутренней стороне цитозольной мембраны. В некоторых дрожжах,таких как Saccharomyces cerevisiae (ген URA1), он находиться в белках плазмы, в то время как в остальных эукариотах в митохондрии.

    Организмы, в которых найдены белки с доменами PF01180 .

    Таксон
    Количество белков с доменом PF01180
    Эукариоты Растения 14
    Грибы 39
    Животные 46
    Бактерии   703
    Археи   45
  • Краткие ответы на следующие вопросы: 3.

    Мотивы в аминокислотной последовательности PYRD_Ecoli по данным БД InterPro

  • Картинка с изображением всех подписей в белке PYRD_Ecoli

    • Мотивы в белке PYRD_Ecoli по данным БД InterPro

    Название подписи
    Положение в последовательности PYRD_Ecoli
    Полное название базы данных
    * Название организации, поддерживающей данную БД.
    * Город и страна
    DHO_dh
    47-336
    Pfam
    Wellcome Trust Sanger Institute

    Institut National de la Recherche Agronomique

    Korean Institute of Science and Technology Information

    Washington University

    Кембридж, Англия

    Франция, Париж.

    Южная Корея, Сеул.

    США, Сент-Луис.
    DHODEHASE_1 80-99 PROSITE Swiss Institute of Bioinformatics Швейцария, Женева
    DHODEHASE_2 292-312 PROSITE Swiss Institute of Bioinformatics Швейцария, Женева
    pyrD_sub2 2-226 TIGRFAMs The Institute for Genomic Research Роквиль, США.
    DHO_oxidase 1-336 PIRSF Georgetown University Medical Center

    MRC Laboratory of Molecular Biology

    European Bioinformatics Institute

    		 Вашингтон,США

    Великобритания, Кэмбридж

    Хинкстон
    Aldolase_TIM 1-336 Gene3D University College London Лондон, Великобритания
    PTHR11938 1-332 PANTHER National Institute of General Medical Sciences США
    PTHR11938:SF7 1-332 PANTHER National Institute of General Medical Sciences США
    SSF51395 1-336 SuperFamily University of Bristol

    University of Texas at Austin

    Stanford University

    		 Бристоль,Англия

    Стендрорд,США
    Главная страница Первый семестр Второй семестр

    ©Петрова Светлана,2007