При помощи Rast была проведена аннотация, а также диаграмму функциональных групп. |
|
Таблица анотаций в rast, табица анотаций в NCBI |
RAST аннотировал 5595 генов белков |
GenBank аннотировал 5204. |
Число совпадающих аннотаций: 4133. |
Число генов, расположенных на обратной цепи, у которых не совпадают старт-кодоны, а стоп-кодоны совпадают: 402 |
Число генов, расположенных на прямой цепи, у которых не совпадают старт-кодоны, а стоп-кодоны совпадают: 426 |
Число генов, аннотированных GenBank, но не RAST: 409 |
Число генов, аннотированные RAST, но не GenBank: 796 |
|
Был еще рассмотрен белок transcriptional regulator, расположенный на обратной цепи. |
Было найдено также нескролько находок как для genbank, так и для rast, лучшие из которых принадлежала Escherichia coli |
Как видно из приведенного рисунка ниже, в данном случае rast (справа) справился лучше genbank (слева) (как видно на рисунке rast совпал старт кодон). |
|
Также белок genbank обладает большей длинной, чем в rast (на 6 кодонов). Если вычесть эти самые 6 аминокислот, то расположение стоп-кодонов, что в rast, что в genbank будет одинаково. |