Задание 1 |
| Алгоритм einverted работает плохо, исподьзованные параметры Gap penalty [12]: 2; Match score [3]: 5; Mismatch score [-4]: -2
|
 |
| find_pair | einverted | Зукер |
| Акцепторный стебель | 1-4 | 1-6 | 1-6 |
| D-стебель | 10-13 | - | |
| T-стебель | - | - | | -
| антикодоновый стебель | 39-43 | - | 36-37 |
| общее число канонических пар | 20 | 6 | 8 |
|
| полярные | неполярные | всего |
| остатками 2'-дезоксирибозы | 6 | 7 | 13 |
| остатками фосфорной кислоты | 14 | 37 | 51 |
| остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки | 8 | 7 | 15 |
| остатками азотистых оснований со стороны малой бороздки | 18 | 14 | 32 |
|
Задание 3 |
|
 |
 |
Задание 4 |
 |
| аминокислотный остаток с наибольшим числом указанных на схеме контактов с ДНК дны Cys450-4 связи |
| аминокислотный остаток, наиболее важный для распознавания последовательности ДНК Arg466, тк он связ через NH группу напрямую с нуклеотидом. |
 |
|
 |
|
 |
|
|
|
|