Практикум 8


7.666%

Задание 1

Организм: Psolus phantapus
Функция последовательности:геномная днк

Задание 2

Ограничивающий таксон Echinozoa
Название методаколичество находокХудшая E valueХудшая ident
Blastn47
discontiguous megablast393e-3676%
megablast148e-6386%
Более подробно в этой таблице
Задание 3
НазваниеФункция:Количество хороших находокE-valueQueryidentдополнительно
CISY_HUMANкатализирует реакцию Acetyl-CoA + H2O + oxaloacetate = citrate + CoA в цикле трикарбоновых кислот. 1 Felis catus telomerase reverse transcriptase (TERT), mRNA 086%59%
HSP7C_HUMANтеломераза - рибонуклеопротеиновый фермент, необходимый для репликации концов хромосомы8 Felis catus FLA extended class II, class II, class III, proximal and central class I region genomic sequence
Felis catus heat shock 70 kDa protein 1/2/5/9, transcript variant X2/1, mRNA
00.075%95Все последовательности, за исключением приведенной, являются предсказанными последовательностями.
PABP2_HUMANучаствует в 3'-концевом формирования предшественников мРНК (пре-мРНК) путем добавления поли (А) хвоста 200-250 нуклеотидов к входному продукту расщепленияFelis catus poly(A) binding protein, nuclear 1 (PABPN1), mRNAТолько предсказаные
RPB1_HUMANсубъединица ДНК-зависимой РНК-полимеразы, которая катализирует транскрипцию ДНК в РНК, используя четыре рибонуклеозидтрифосфата в качестве субстратаFelis catus polymerase (RNA) II/III (DNA directed) polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA 081%95Только предсказанные
TERT_HUMANдействует как репрессор транскрипцию активацииFelis catus histone H3.1 (LOC101094758), mRNA 2e-5896%89
Задание 4
Выбранный организм:Turnip rosette virus
Выбранные родственные организмы: Imperata yellow mottle virus

Lucerne transient streak virus isolate LTSV-Can
Ryegrass mottle virus isolate MAFF. No. 307043 from Japan
Sesbania mosaic virus
Subterranean clover mottle virus
Полученные результаты: таблица
Cходство для этих организмов весьма высокое, что обусловленно темб что они принадлежат одному и тому же типу.

Третий семестр

Главная страница


© Полина Николаева 2014.