работа с KEGG Orthology |
Задание 1 |
| Выбранный путь | Taurine and hypotaurine metabolism |
| |
| Класс | Metabolism; Metabolism of other amino acids |
| Выбранная рекция | R02466 |
| Схема реакции: | |
| Механизм реакции | C00606 <=> C00519 + C00011 |
| C00606 | 3-Sulfino-L-alanine |
| C00519 | Hypotaurine |
| C00011 | CO2 |
| В данном пути участвеют два ортолигичных белка в данной реакции участвуют два ортологичных белка: K01594 и K18966. | |
| их названия соотвественно sulfinoalanine decarboxylase [EC:4.1.1.29] и sulfinoalanine decarboxylase / aspartate 1-decarboxylase [EC:4.1.1.29 4.1.1.11] | |
| колличество соотвественно 42 и 17 | |
Задание 2 и 3 |
| Ссылки на список белков ортологических рядов K01594 и K18966 | ||
| Рис. 1 Выравнивание изначального набора белков (уже покрашенное при помощи ClustlX) | ||
 | ||
| Рис. 2 "Вычищенное" выравнивание | ||
 | ||
| Оба ряда очень сходны по своему строению, обладают одинаковым количеством сходных доменов. Для построения дерева были удалены последовательности необладающие всеми доменами. | ||
| Рис. 3 Построенное дерево | ||
 | ||
| Где синим отмечены ветви K18966 , оранжевым - K01594, сиреневым - смешанные ветви. | ||
Не смотря на внешне весьма сходную структуру смешанных ветвей мало, но при этом четко видны две ветви резделяющие эти два ряда<><>
|