| Белок |
Порфобилиноген синтеза (дельта-аминолевулиновая кислота дегидратазы) |
| Организм |
Pirellula staleyi |
| Количество найденных белков, относящих белок к какому-нибудь КОГ |
1 |
| Название белка |
HemB |
| Идентификатор КОГа |
COG0113 |
| Название |
Delta-aminolevulinic acid dehydratase, porphobilinogen synthase(совпадает с исходным) |
| E-value |
0e+00(потому что это этот же белок) |
| Интервал попадания |
весь белок |
|
Задание 2 |
 |
| Данное изображение быо получено при помощи STRING. Здесь изображено геномное окружение белка, где белки отображены в виде узлов,
а их взаимотношения в виде цветных ветвей. Сам белок находится в центре и имеет название: psta_2811 |
| Параметры были взяты по умолчанию: максимальное количество взаимодействующих по первой линии белков (first shell interactors) - 10,
минимальный требуемый score взаимодействия - 0.400 |
| Все узлы однотипны и означают, что 3D струтра белков не известна, но все они взаимодествуют по первой линии белков |
 |
| Известные взаимодействия |
| голубой | из курируемых базы данных |
| малиновый | экспериментально доказаные |
|
| Предсказанные взаимодействия |
| Зеленый | соседство |
| Красный | слияние |
| Синий | совместная встречаемость |
|
| Остальное |
| Желтый | совместное упоминание |
| Чёрный | ко-экспрессия |
| Небесный | гомология |
|
|
|
 |
| По выше привиденным изображением, мой белок имеет взаимодействие с: hemC, hemL, psta_0166, psta_4664, hemA, Psta_2973,Psta_2810,truB,hemH. Т.к. взаимодествие консервативное, то ибелки должны распологаться рядом |