UCSC
В UCSC браузере была найдена субъединица рецептора гамма-аминомасляной кислоты gamma3 с идентификатором в Swiss-Prot "GBRG3_HUMAN". Краткое описание гена приведено в таблице 1:
Название гена |
GABRG3 |
Цепь |
+ |
Хромосома |
15 |
Плечо и бэнд |
q12 |
Координаты гена в последовательности хромосомы |
216,429-27,778,373 |
Количество альтернативных продуктов |
1 |
Число экзонов |
10 |
Длина аминокислотной последовательности |
467 |
Получена картинка окрестности гена из Genome Browser:
Изображение окрестности гена
EnsEMBL
Результаты выравнивания гена белка GBRG3_HUMAN с гомологичным геном шимпанзе приведены в таблице 1:
Частота различий |
на 100 пар оснований приходится 1,44 несовпадений |
Частота часто встречающихся полиморфизмов |
на 100 пар оснований приходится 5,75 несовпадений |
Получается, если в взять двух людей с максимально возможным несовпадением в этом гене, то для них ген будет различаться больше, чем у шимпанзе и человека.
Выравнивание (скачать) находится в рабочей директории: H:\term3\block3\practice15.