Для построения дерева из предложенного списка были выбраны 7 бактерий (случайным образом) с мнемониками PASMU, PSEMY, NEIMA, BURCA, ACICJ, ROSDO, BRUSU (см. таблицу 1 с расшифровками). Дерево для этих семи бактерий было построено по дереву, приведенному на странице с заданиями, методом исключения всех остальных бактерий.
| мнемоника | видовое название |
| PASMU | Pasteurella multocida |
| PSEMY | Pseudomonas mendocina |
| NEIMA | Neisseria meningitidis |
| BURCA | Burkholderia cenocepacia |
| ACICJ | Acidiphilium cryptum |
| ROSDO | Roseobacter denitrificans |
| BRUSU | Brucella suis |
Таблица 1. Выбранные бактерии и их мнемоники.
Скобочная формула полученного дерева имеет вид:
(((PASMU, PSEMY), (NEIMA, BURCA)), (ACICJ, (ROSDO, BRUSU)))
Рисунок 1. Филогенетическое дерево, построенной в программе MEGA по скобочной формуле, сохранённой c расширением .tre.
4 нетривиальные ветви образуют разбиения множетсва листьев (кажется, у любого разрешенного дерева с семью листьями 4 нетривиальные ветви):
На этом дереве ветвь {PASMU, PSEMY} отделяет гаммапротеобактерий (Gammaproteobacteria), ветвь {NEIMA, BURCA} отделяет бетапротеобактерий (Betaproteobacteria), а ветвь {ROSDO, BRUSU, ACICJ} отделяет альфапротеобактерий (Alphaproteobacteria).
Вернуться на страницу семестра
© potapenko 2017-2018