Главная

О себе

Семестры

Краткое описание генома бактерии Streptomyces avermitilis

Классификация [1] :

• Надцарство: Bacteria
• Тип: Actinobacteria
• Класс: Actinobacteria
• Отряд: Streptomycetales
• Семейство: Streptomycetaceae
• Род: Streptomyces
• Вид: Streptomyces avermitilis

Streptomyces avermectinius (avermitilis) : sole source of the avermectins (credit: Kitasato Institute) [2]

Бактерии рода Streptomyces широко распространены в природе, особенно в почве. Характерный "землистый" запах свежевспаханной земли на самом деле определяется ароматическим терпеноидом геосмином, который вырабатывается видами Streptomyces . Известны как важнейшие индустриальные продуценты многих антибиотиков и других вторичных метаболитов антибактериальной, антигрибковой, антивирусной и противоопухолевой природы. Streptomyces играют важную роль в почвенной среде, потому что разнообразные метаболические пути позволяют им разлагать плсяохоразлагающие остатки других организмов, включая хитин и и лигноцеллюлозу. Особенностью представителей этого рода является наличие типа-I пептидокликана в стенках клетки, который содержит характерные межпептидные глициновые мостики. Другой отличительной чертой Streptomyces является то, что они содержат очень большие (примерно 8 миллионов пар нуклеотидов, что в два раза больше чем большинство геномов бактеорий) линейные хромосомы, в отличие от многих других бактерий, которые имеют кольцевые хромосомы.

Вид Streptomyces avermitilis является широко известным продуцентом авермектина, использующееся как основное вещество лекарственный препаратов против инвазий, вызываемые нематодами и членистоногими.

Молекулярная структура авермектинов [3]

Геном Streptomyces avermitilis также представлен линейной двуцепочечной молекулой ДНК и плазмидой SAP1. Его размер составляет 9124287 п.н. и содержит 7770 генов. Геном был секвенирован в 2003 году [1] .

Описание белка и его геномного окружения

© Potemkina Elena, 2016