|
Uniprot
Информация о белке Alpha-galactosidase
Комментарии к таблице 1:
Другое название - мелибиаза. Это гликозил-гидролаза, способная отщеплять, как правило с сохранением их оптической
конфигурации, терминальные нередуцирующие остатки альфа-D-галактозы от альфа-D-галактозидов, в том числе от галактоолигосахаридов,
галактоманнанов и галактолипидов. Её простейшими природными субстратами являются дисахарид мелибиоза и трисахарид раффиноза.[1]
Указана систематика организма, из которого был получен белок: Bacteria; Actinobacteria; Streptomycetales; Streptomycetaceae;
Streptomyces .
Не указан PDB ID, следовательно, белка нет в базе данных PDB
Таблица 1. Информация о белке Alpha-galactosidase
| Uniprot ID | Uniprot AC | Refseq ID | PDB ID | Длина (а.о.) | Молекулярная масса (а.е.м.) | Рекомендуемое Uniprot название |
| Q82P56_STRAW | Q82P56 | WP_010982515.1 | - | 608 | 64940 | Alpha-galactosidase {ECO:0000256|RuleBase:RU361168} |
Таблица 2. Описание кластеров Uniref для Alpha-galactosidase
| Кластер | Идентификатор | Количество белков |
| UniRef100 | UniRef100_Q82P56 | 1 |
| UniRef90 | UniRef90_Q82P56 | 5 |
| UniRef50 | UniRef50_Q82P56 | 87 |
Результаты сеансов поиска в Uniprot
Таблица 3. Результаты сеансов поиска в Uniprot
| Поиск | Текст поиска | Количество белков | Reviewed |
| Поиск по рекомендованному названию белка | name:"alpha-galactosidase" | 11955 | 92 |
| Поиск по рекомендованному названию среди белков данного организма | name:"alpha galactosidase" organism:"strain atcc 31267 dsm 46492 jcm 5070 nbrc 14893 ncimb 12804 nrrl 8165 ma 4680"
| 7 | 1 |
| Поиск по рекомендованному названию среди белков организмов того же семейства | name:"alpha galactosidase" taxonomy:"Streptomycetaceae [2062]" |
778 | 3 |
| Поиск по рекомендованному названию среди белков организмов того же отдела | name:"alpha galactosidase" taxonomy:"Actinobacteria [201174]" |
2146 | 3 |
| Поиск по lysozyme без ограничения на организмы | name:"lysozyme" | 17921 | 229 |
| Поиск по lysozyme среди Metazoa | name:"lysozyme" taxonomy:"Metazoa [33208]" | 1533 | 148 |
| Поиск lysozyme среди Fungi | name:"lysozyme" taxonomy:"Fungi [4751]" | 183 | 2 |
| Поиск trypsin | name:"trypsin" | 13241 | 310 |
| Поиск inhibitor of trypsin | name:"trypsin" name:"inhibitor" | 2962 | 209 |
История изменений записи Uniprot о данном белке
С помощью функции "History" была изучена история изменений записи о данной Alpha-galactosidase. Первая версия была загружена 1 июня 2003 года. Последняя 85 версия - 2 ноября 2016. В последней версии указано рекомендованное имя
для белка, появилось множество ссылок на другие ресурсы (GO, Gene3D, InterPro, Pfam, PRINTS, SUPFAM, PROSITE), в отличие от самой ранней версии.
Источники [1] Альфа-галактозидаза
© Potemkina Elena, 2016
|