Главная

О себе

Семестры

Краткое описание генома вируса Kashmir bee virus

Общая информация

Классификация [1] :

  • Надцарство: Viruses
  • (без ранга): ssRNA viruses
  • (без ранга): ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage
  • Отряд: Picornavirales
  • Семейство: Dicistroviridae
  • Род: Aparavirus
  • Вид: Kashmir bee virus

Kashmir bee virus (далее KBV ), распространенный в Северной Америке и Новой Зеландии, инфицирует многие виды пчел, включая Apis mellifera , европейскую медоносную пчелу [2]. Вирус поражает как молодых, так и взрослых особей. Заболевшие вирусом Кашмира взрослые пчелы умирают в течение нескольких дней от воздействия вируса, но перорально зараженные личиники могут выжить и развиться в бессимптомно инфицированных взрослых [3] . KBV распространяется между особями в колонии и между колониями с помощью многих способов передачи. KBV может попасть в улей через клещей (например, Varroa destructor ) [4], в которых также может происходить репликация вируса, и далее распространяться между рабочими пчелами; может передаваться от матки к потомству - трансовариальный путь передачи возбудителя заболевания. Вирусная РНК также была найдена в источниках питания пчел (мед, пища для потомства, маточное молочко). Так как эти источники питания частично состоят из выделений рабочих пчел, то это, вероятно, и есть способ передачи вируса от пчелы к пчеле. Заражение KBV не дает визуально определяющихся специфических признаков паталогии [5] . Обычно встречается у пчел в сочетании с другими вирусными инфекциями.
Вирион KBV имеет не имеющий оболочки икосаэдральный капсид, состоящий из 3 структурных белков [6] . В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие Kashmir bee virus [1] .



Таблица 1. Основные параметры генома Kashmir bee virus


Параметр Значение
Английское (или латинское) название вируса Kashmir bee virus
Русское название вируса Кашмирский вирус пчел
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 9524
Количество кодируемых в геноме полипептидов 2
Количество "зрелых" вирусных белков 4

Аминокислотная последовательность кратчайшего белка (69 аминокислот): 
>YP_308661.1 VP4
IATPNKSKSTKPTSENPKIGPISEVASGVKTAANGIERIPVLGEIAKPVTAAVKWFADIV
GGVAAIFGW

Источники:


[1] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid68876[orgn]
[2] de Miranda, J.R., M. Drebot, S. TylerM. Shen, C.E. Cameron, D.B. Stoltz, S.M. Camazine. “Complete nucleotide sequence of Kashmir bee virus and comparison with acute bee paralysis.” Journal of General Virology 85 (2004): 2263-2270.
[3] Berenyi, O., T. Bakonyi, I. Derakhshifar, H. Koglberger, N. Nowotny. “Occurrence of Six Honeybee Viruses in Diseased Australian Apiaries.” Applied and Environmental Microbiology 72.4 (2006): 2412-2420.
[4] Chen, Y.P., J.S. Pettis, A. Collins, M.F. Feldaufer. “Prevalence and Transmission of Honeybee Viruses.” Applied and Environmental Microbiology 72.1 (2006): 606-611.
[5] Shen, M., L. Cui, N. Ostiguy, D. Cox-Foster. “Intricate transmission routes and interactions between picorna-like viruses (Kashmir bee virus and sacbrood virus) with the honeybee host and the parasitic varroa mite.” Journal of General Virology 86 (2005): 2281-2289.
[6] https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Kashmir_Bee_Virus

© Potemkina Elena, 2016