Описание белка предполагаемой экспортируемой протеазы (putative exported protease) из генома бактерии Chlamydia trachomatis штамма Sweden2
В таблице 1 дано информация о гене белка Cpa, полученная из записи NC_ 017441.1 базы данных RefSeq. На рисунке 1 показано окружение гена cpa.
Рис. 1. Окружение гена cpa в геноме Chlamydia trachomatis Sweden2. Расстояние между cpa и геном из локуса SW2_8731 – 113 нуклеотидов, между геном cpa и геном ispH – 94 нуклеотидов. Расстояния достаточно большие, чтобы считать возможным, но маловероятным вхождение гена cpa в оперон.
Таблица 1. Информация о предполагаемой экспортируемой протеазе из генома Chlamydia trachomatis Sweden2 (идентификатор YP_005816496.1 в базе RefSeq)
| Вид информации | Квалификатор в записи генома | Значение |
| Локус гена в геноме | /locus_tag | SW2_8741 |
| Имя гена | /gene | Cpa |
| Идентификатор гена в базе Gene | /db_xref=”GeneID:…” | 12594404 |
| Начало гена в геноме | 1010787 | |
| Конец гена в геноме | 1012592 | |
| Ориентация гена | +1 | |
| Длина гена (в п.н.) | 1806 | |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein | /protein_id | YP_005816496 |
| Длина белка (в а.к. остатках) | 601 |
Информация о белке получена на странице белка и его бактерии сайта NCBI.