Для поиска белка в качестве запроса было использовано название бактерии, а именно: Pantoea eucrina. Число найденных белков составило 41. Запрос: (organism_id:472693) AND (existence:1). Был выбран фермент ДНК-гираза (B0LIU0_9GAMM), так как среди вариантов этот белок был наиболее аннотирован.
Функция субъединицы В ДНК-гиразы (EC:5.6.2.2) - АТФ-зависимый разрыв двухцепочечной ДНК.
Поиск кластеров проводился в базе данных UniRef по запросу: (uniprot_id:B0LIU0). Анализ размеров кластеров UniRef, к которым относится данный белок, позволяет сделать предположение, что данный белок достаточно широко распространен среди организмов,его последовательность консервативна (огромные размеры кластера UniRef50, с отставанием практически в 17 раз размер кластера UniRef90 и несравнимо маленький размер кластера UniRef100).
Для начала была произведена проверка на существование такого белка (по классификации ферментов (EC:5.6.2.2 )) у человека. Поиск ничего не показал. Запрос: (ec:5.6.2.2 ) AND (organism_id:9606).
По запросу (protein_name:"DNA gyrase subunit B") AND (structure_3d:true) выяснено, что у этого белка получали 3D структуру (17 результатов).
Было проверено распространен ли этот белок среди организмов. Запрос показал 49723 результата, это позволило сделать вывод, что белок не является отличительной «чертой» бактерии: (protein_name:"DNA gyrase subunit B").