Практикум 14

Файл с проектом: файл

Протокол практикума

Ниже представлена информация о выбранной группе белков:

Весь проект покрашен в соответствии со схемой ClustralX, кроме рассматриваемых блоков.

Вертикальный плюс-блок

Для нахождения плюс-блоков использовались два паттерна: w[ktqr][lq]ey и c[kq].........ld. Второй паттерн находит единственно возможные колонки, хоть и имеется более точное задание паттерна, он был задан так для сохранения времени. Данные блоки расположены на позициях с 70 по 74 и с 126 по 138 соответственно. Обозначение: V. Для удобства покрашен в синий цвет.

Частичный плюс-блок

Для нахождения частичных плюс-блоков использовались два паттерна: s[lag]fv[as]pavtp и nnp[gas][vilf]r. Данные блоки расположены на позициях с 5 по 14 и с 25 по 30 соответственно. Обозначение: P. Для удобства покрашен в золотой цвет.

Минус-блок

Для данного блока паттерн составить нельзя, однако можно найти позиции. Для такого блока позиции в данной работе составили с 31 по 36. Обозначение: M. Не имеет индивидуальной расскраски.