Terms
|
Other results
|
Home page
|
| |
|
Отчет по 7-ому занятию. Коврова Дениса. П1.
В ходе изучения трех файлов была составлена следующая таблица :
| |
A-форма |
B-форма |
Файл dna27.pdb |
| Тип спирали (правая или левая) |
Правая |
Правая |
Правая |
| Шаг спирали (Å) |
28.02 |
33.75 |
(G36B.P – G26B.P) 26.63 |
| Число оснований на виток |
11 |
10 |
(—||—) 10 |
| Ширина большой бороздки |
(G21B.P–A6A.P) 7.96 |
(C4A.P-A26B) 17.20 |
(C34B.P – G8A.P) 11.75 |
| Ширина малой бороздки |
(T27B.P-G9A.P) 16.96 |
(G25B.P – C12A.P) 11.69 |
(G36B.P-A15A.P) 15.297 |
При изучении этой таблицы можно обратить внимание на то, что часть параметров файла dna27
близка к А форме, а часть к B форме а при последующем изучении средних торсионных углов
видно, что они сильно отличаются от обеих форм:
Эти результаты навели на мысль, что что-то в этой ДНК не так, и действительно при последующем
изучении обнаружились азотистые основания урацила а при изучении сахаров – у всех нуклеотидов
оказалась обычная рибоза.
Самым интересным оказалось, что файлы полученные с посощью программ анализатор и find_pair содержат всю
эту информацию начиная от типа спирали заканчивая не Уотсон-Крик взаимодействиями, модифицировнными основаниями
и всякого рода расстояниями которые в данном упражнении приходилось измерять вручную.
Ну и конечно в нем присутствуют торчиооные все торсионные углы=)
Последнее задание тяжело коментировать - вот картинки:
dnaA
dnaB
dna27
|