Terms
|
Other results
|
Home page
|
| |
|
CUC
/ [L] \
CAC CUU
[H] \ / [L]
CAU
[H]
Для данной замены существует два минимальных по длине пути. Они оба представлены на схеме.
Под кодонами записаны однобуквенные идентификаторы аминокислот.
|
| Кодоны |
С |
A |
C |
|
|
C |
A |
U |
|
|
C |
U |
C |
| Синонимичный сайт. |
0 |
0 |
1/3 |
|
|
0 |
0 |
1/3 |
|
|
0 |
0 |
1 |
| Несинонимичный сайт |
1 |
1 |
2/3 |
|
|
1 |
1 |
2/3 |
|
|
1 |
1 |
0 |
Заметим, что не смотря на то, что у лейцина существует 6 кодонов, он из данного положения
одной заменой не сможет в 2 из них перейти, поэтому синонимичность сайтов именно такая.
|
| Путь |
Син. сайты |
Несин.сайты |
| 1 |
2/3 |
5+1/3 |
| 2 |
1 + 1/3 |
4 + 2/3 |
| ср. |
1 |
5 |
|
| Na |
Pa |
Ka |
Ns |
Ps |
Ks |
Ka/Ks |
| 1 |
5 |
1/5 |
1 |
1 |
1 |
1/5 |
|
|
|
Так как коэфициент меньше единицы, то можно предположить, что происходит стабилизация генома.
Заметим так же, что т.к. мы не знаем в какую сторону шла эволюция, то мы должны посчитать значение Ka\Ks для двух случаев.
И если предположить, что эволюция шла "справа налево", то доля синонимичных сайтов вырастет, а следовательно
вырастет и коэффициент до 5/13. Но он тоже меньше единицы. Поэтому принципиально ответ не изменится.
(Вторые вычисления не приводил из-за аналогичности с первыми)
|