Описание L-лизин-6-оксидазы из генома Marinomonas mediterranea MMB-1.

Описание L-лизин-6-оксидазы

В ходе этого практикума мной был оформлен отчет о белке в формате html.

Таблица 1. Описание L-лизин-6-оксидазы
Идентификатор белка ADZ91893.1
Идентификатор генома CP002583.1
Название белка L-лизин-6-оксидаза
Координаты гена в геноме 2940270..2942450
Длина гена (п.н.) 2181
Цепь Обратная
Длина белка (а.о.) 726

Последовательность получена с сайта NCBI при выполнении предыдущего практикума Аминокислотная последовательность в формате fasta

Белок имеет антибактериальные свойства и действует на многих грамположительных и грамотрицательных бактерий. Отвечает за смерть микроорганизмов в биопленке, что связано с расширением генофонда и играет важную роль в колонизации.

Геномное окружение белка

Геномное окружение белка

Рисунок 1. Геномное окружение гена белка L-лизин-6-оксидазы ADZ91893.1. Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI.

На рисунке видно расположение гена рассматриваемого белка в геноме бактерии. Красные блоки означают гены, а стрелки - направление их транскрипции.

Назад

©Дашьян Мария, 2018